LabDAO kartoittaa avoimen lähdekoodin tekoälyn tulevaisuutta huumeiden löytämisessä

Folding@home-projekti nousi otsikoihin koko COVID-19-pandemian aikana käyttämättömän laskentatehon jakamisesta proteiinien taittuvan hakutilan tutkimiseksi uuden koronaviruksen torjumiseksi. Aloite antoi kansalaisille mahdollisuuden olla omia tiedemiehiä, ja se suoritti laajamittaisia ​​simulaatioita proteiinien eri molekyylikokoonpanoista hajautetussa "rekisteröityjen" tietokoneiden verkossa ympäri maailmaa.

Tätä hajautettua paradigmaa saarnattiin ihmisten yhdistämiseksi yhteisen ongelman ympärille ja laskentatehon tehokkaaseen joukkolähteeseen, mutta entä jos laskentateho ja ongelmanratkaisuinfrastruktuuri käänteisivät? Toisin sanoen, mitä jos ihmiset voisivat toteuttaa omia projektejaan hyödyntämällä kertynyttä laskentatehoa ja työkalut biologiseen kokeiluun käynnistykseen?

LabDAO tekee tästä unelmasta totta PLEX-alustallaan. PLEX on avoimen lähdekoodin komentorivityökalu, joka on suunniteltu tekemään laskentaresurssien lisäksi myös erilaisia ​​biologisia koneoppimistyökaluja (joista luotiin LabDAO:n "BioML" -paketti) käytettäviksi useilla eri taustoilla. Kokeilitpa sitten pienmolekyylien telakointia tai omia proteiinien taittosimulaatioita, PLEX antaa käyttäjille mahdollisuuden hyödyntää LabDAO:n työkalukirjastoa, jakaa tuloksia ja visualisoida ne alle viidessä minuutissa.

Tämä työkalusarja ja sen päällä oleva käyttö mahdollistava alusta esiteltiin Zuzalun Blockchain Meets Biology -huippukokouksessa huhtikuun alussa, jossa LabDAO Core Teamin jäsen Lily Hansen-Gillis esitteli alusta loppuun simulaation sisäisestä molekyylidynamiikasta. proteiinia löytääkseen sen vakaimman konfiguraation. Sitten itseään "ei-koodaajana" pitävänä hän opasti yleisön sen läpi alusta loppuun – kaikki tietokone, WiFi, PLEX komentorivillä ja ei mitään muuta.

Laajemmin LabDAO on web3-yhteensopiva hajautettu alusta (osa suurempaa "DeSci"-liikettä), joka on sitoutunut luomaan tuottavamman ympäristön avoimen lähdekoodin lääkekehitykseen. LabDAO pyrkii luomaan oikean ympäristön läpinäkyville ja saavutettavissa oleville tieteellisille edistysaskeleille tarjoamalla huippuluokan työkaluja ja resursseja laajemman ekosysteemin käyttöön. Poistamalla tutkijoilta oman laitteiston tai laskentainfrastruktuurin tarpeen tai julkaisemalla kokeiden tuloksia lohkoketjureskontrassa siten, että ne ovat seurattavissa ja toistettavissa, organisaatio on sitoutunut mahdollistamaan enemmän innovaatioita yhteistyön avulla – murtamaan köyhyyden aiheuttamia esteitä. käytettävyys ja siiloinen, niche-asiantuntemus.

LabDAO:n pyrkimykset rakentaa tämä tulevaisuuden DeSci-maailma tänään saivat äskettäin sysäyksen 3.6 miljoonan dollarin rahoituskierroksen muodossa useilta muilta DAO:ilta, Inflection.xyz:ltä, Balaji Srinivasanilta ja muilta. Tämä tuen tulva myötävaikuttaa jatkuviin ponnisteluihin avoimen lähdekoodin ohjelmistotyökalujen kehittämiseksi ja LabDAO:n tutkimusekosysteemin vahvistamiseksi.

Mitä tulee itse PLEXiin, välittömät seuraavat askeleet horisontissa sisältävät alustan testaamisen erilaisissa tieteellisissä yhteistyöhankkeissa, erilaisten työkalujen kontissa ja tarvittavan laitteiston keräämisen BioML-verkon edistämiseksi.

Mitä pitkällä aikavälillä tulee, ehkä seuraava hengenpelastuslääke seuraavan suuren tartuntatautiepidemian aikana suunnitellaan PLEXin voimalla, yksi hajautettu askel eteenpäin kerrallaan. Kun ekosysteemi jatkaa kasvuaan, vain aika näyttää.

Kiitos Aishani Aatresh saadaksesi lisätutkimuksia ja raportteja tästä artikkelista. Olen SynBioBetan perustaja, ja osa yrityksistä, joista kirjoitan, ovat sen sponsoreita SynBioBeta-konferenssi. Jos haluat lisää sisältöä, voit tilata viikoittainen uutiskirjeeni.